Dans un futur proche, la technologie a progressé. Sur les réseaux sociaux, des rumeurs se répandent sur un mystérieux phénomène autour d’un « fantôme hologramme ». Lorsque le collégien Hiro Amanokawa active un étrange objet laissé par son père, il parvient à voir de mystérieuses créatures appelées Digimon. C'est ainsi que Hiro rencontre l'espiègle Gammamon avec lequel il va désormais affronter des monstres effrayants qui terrorisent le monde des humains.

Dans un futur proche, la technologie a progressé. Sur les réseaux sociaux, des rumeurs se répandent sur un mystérieux phénomène autour d’un « fantôme hologramme ». Lorsque le collégien Hiro Amanokawa active un étrange objet laissé par son père, il parvient à voir de mystérieuses créatures appelées Digimon. C'est ainsi que Hiro rencontre l'espiègle Gammamon avec lequel il va désormais affronter des monstres effrayants qui terrorisent le monde des humains.

Dans une Chine du XVIIème siècle, le dix septième empereur de la dynastie Sokanest décédé. Comme le veut la tradition, le palais intérieurs où sont logées toutes ses femmes est détruit et toutes doivent quitter la capitale. Seule l'impératrice Dowager, la première femme, a le droit de rester. Hélas pour elle, elle ne parvient pas à faire couronner son fils de onze ans parce que ses ennemis qui la soupçonnent d'avoir empoisonné son mari, la prennent de vitesse et font sacrer un autre fils de l'Empereur. Pour consolider le trône, les eunuques s'empressent d'envoyer des délégations a travers tout le pays afin de trouver des candidates pour devenir la première femme du nouvel Empereur. À Oda, la jeune Ginga apprend la nouvelle et décide de tenter sa chance bien qu'elle soit la fille d'un modeste potier. Elle convainc l'eunuque venu sélectionné des candidates dans sa région et repart avec lui vers la capitale.

Akihabara@DEEP nous raconte l'histoire de Page, Box, Akira, Taiko, Daruma, et Izumu, six otaku qui épanchent les petites douleurs de leurs vies sur le site internet appelé « le garde du corps de Yui ». À la mort du webmaster Yui, les six otaku, qui sont chacuns des experts dans leur domaine, se regroupent pour former le « Akihabara@DEEP », un groupe qui se voue a protéger le quartier d'Akihabara et à régler les problèmes de ses habitants…

Près de vingt ans après être entré dans le XXIe siècle, les gens ont complètement oublié l'existence des yôkai, ces créatures fantastiques issues du folklore japonais. Quand plusieurs phénomènes inexpliqués sèment le désordre dans ce monde moderne, Mana, 13 ans, écrit une lettre destinée au monde des yôkai. Elle est reçue par un certain Kitarô…

Depuis longtemps, un groupe de dix digimon ont donné leur vie pour vaincre les forces du mal qui menaçaient le digimonde. Ces guerriers ont créé des artéfacts depuis leurs propres données, les douze esprits avant de laisser le digimonde entre les mains de trois digimon célestes. Cependant, l'un de ces trois digimon, Cherubimon, décide d'emprisonner ces compagnons afin de régner en maître2,3. Pour remédier à cette situation, un autre digimon céleste Ophanimon invoque cinq jeunes enfants élus du monde réel grâce aux Trailmon (digimon à l'apparence de trains hybrides). Dans le digimonde, ces cinq élus trouvent deux esprits, chacun pour se transformer en guerriers digimon. Cependant, tandis qu'ils trouvent leurs esprits respectifs, les cinq élus sont pris en chasse par plusieurs digimon, sbires de Cherubimon