Sam Flynn, 27 ans, est le fils expert en technologie de Kevin Flynn. Cherchant à percer le mystère de la disparition de son père, il se retrouve aspiré dans ce même monde de programmes redoutables et de jeux mortels où vit son père depuis 25 ans. Avec la fidèle confidente de Kevin, père et fils s'engagent dans un voyage où la mort guette, à travers un cyber univers époustouflant visuellement, devenu plus avancé technologiquement et plus dangereux que jamais...

Beck, jeune programme mécanicien, est confronté à la loi martiale appliquée par le général Tesler envoyé par Clu dans son secteur de la grille. Beck rencontre le héros Tron et, entraîné par lui, devient le Renégat, figure montante de la révolte.

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