Au printemps, deux jeunes filles se rencontrent : Mato Kuroi et Yomi Takanashi. Malgré qu'elles aient des personnalités littéralement opposées, elles vont vite devenir amies. Mais dans un autre monde, inconnu au nôtre, sévit une guerre. Dans cet univers parallèle vit l'alter ego de chaque personnage humain, dont celui de Mato : une jeune fille nommée Black Rock Shooter. Elle possède un signe distinctif, un œil où brûle une flamme bleue, et elle se jette à corps perdu dans la bataille en brandissant une arme à feu géante, son Rock Canon. Deux mondes différents. Mato et Black Rock Shooter. Voici le conte de leur "douleur".

La société de production Green Leaves Entertainment présidée par Junko Tange est en faillite financière. Pour tenter de sortir la tête de l'eau, la présidente va charger Kôhei Matsuda, un manager de la société, de trouver de nouveaux talents en matière d'idole. C'est dans la région de Tohoku que Kôhei va trouver sept jeune filles d'environ 15 ans douées en chant et en danse : Mayu Shimada, Airi Hayashida, Minami Katayama, Yoshino Nanase, Nanami Hisami, Kaya Kikuma et Miyu Okamoto. C'est ensemble qu'ils vont monter leur propre groupe d'idoles et tenter de monter au sommet si difficile à atteindre.

Mato Kuroi est une étudiante qui entre au Lycée. Elle va y rencontrer Yomi Takanashi avec qui elle va vite devenir amie. Malgré leurs personnalités opposées, elles vont vivre leur première année de Lycée ensemble... Mais au même moment dans un monde parallèle au leur, deux jeunes filles se livrent bataille, deux jeunes filles qui ressemblent à Mato et Yumi... Pourquoi cette ressemblance ? Et quel lien y a-t-il entre ces deux monde ?

Au printemps, deux jeunes filles se rencontrent : Mato Kuroi et Yomi Takanashi. Malgré qu'elles aient des personnalités littéralement opposées, elles vont vite devenir amies. Mais dans un autre monde, inconnu au nôtre, sévit une guerre. Dans cet univers parallèle vit l'alter ego de chaque personnage humain, dont celui de Mato : une jeune fille nommée Black Rock Shooter. Elle possède un signe distinctif, un œil où brûle une flamme bleue, et elle se jette à corps perdu dans la bataille en brandissant une arme à feu géante, son Rock Canon. Deux mondes différents. Mato et Black Rock Shooter. Voici le conte de leur "douleur".

Autrefois, un Roi Démon terrorisait le monde avec ses armées démoniaques. Mais un jour, un Héros arriva et scella le monstre et ses sbires. Bien des années plus tard, alors que la paix régnait sur le monde, un trou béant apparu, sans aucune raison apparente. De ce trou sortirent de nombreux démons. 75 descendants du Héros (ou du moins des jeunes gens courageux et motivés, le lien du sang n'étant pas prouvé) furent alors chargés de vaincre cette nouvelle menace. Alba est le "Héros numéro 45". Accompagné de Ross, un soldat royal, il voyage afin d'accomplir sa mission. Mais les choses sont loin d'être faciles, surtout que Ross semble considérer Alba comme sa cible privilégiée.