Un été mouvementé se termine. Après la disparition tragique de Kazuya, Tatsuya et Minami reprennent les cours au lycée Meisei.Tatsuya rejoint l'équipe de base ball de l'école et souhaite réaliser la promesse de son défunt frère faite à Minami : emmener cette dernière au Kôshien.Minami quant à elle, quitte le club de base ball et rejoint le club de gymnastique.Tatsuya fera la connaissance de Nitta Akio, joueur de l'équipe de Sumi, se posant à lui comme son rival en base ball mais aussi en amour...Ce deuxième film de 1986, reprends donc la deuxième saison, à l'image du premier film, beaucoup de différences par rapport à la série tv.

Toujours au sein de l'équipe de pilotage du Projet D, Takumi Fujiwara et Keisuke Takahashi continuent de défier les parcours et les équipes de la préfecture de Kanagawa. Pendant ce temps, un jeune phénomène du golf attire l'attention de Takumi, et Ryosuke Takahashi règle un compte du passé.

L'histoire commence lorsque des coureurs de rue appelés les RedSuns, une équipe du Mont Akagi, viennent défier l'équipe locale des SpeedStars du Mont Akina pour une course "amicale". Après avoir constaté l'habileté des RedSuns, les SpeedStars traitent cette course comme une épreuve de fierté, bien décidés à ne pas être humiliés sur leur propre terrain. Cependant, les SpeedStars se retrouvent dans une situation délicate lorsque leur chef d'équipe et principal pilote de descente, Iketani, a un accident pendant un entraînement.

Au Mont Akina, les courses entre pilotes chevronnés ne cessent de se dérouler tous les week-ends. Mais l'équipe locale des Speedstars semble dépassée par l'arrivée massive de stars du volant. Devant l'impossibilité de relever un défi qui leur est proposé, une seule solution apparaît : faire confiance la légende urbaine qui court sur un mystérieux pilote local qui dévale la montagne à toute allure. Personne n'irait alors soupçonner Takumi Fujiwara, un lycéen de dix-huit ans assez rêveur et ne connaissant rien aux voitures, d'être ce génie du volant. Le jeune homme ne fait que livrer le tofu familial dans la région... Par conséquent, il connaît les routes du coin par coeur qu'il aborde au volant de sa Trueno 86, une vieille voiture encore performante... à une vitesse hallucinante.

Takumi va bientôt être diplôme et pense à son avenir, il ne sait pas trop ce qu'il veut faire. Ryosuke lui propose d'intégrer une nouvelle équipe des meilleurs racers de Gunma pour un an. Son but est de parcourir le Japon pour défier les plus grandes teams et imposer leurs records. Takumi préfère réfléchir quelques temps à cette proposition et pour cela il décide d'effectuer plusieurs matchs.

Wangan Midnight raconte l'histoire d'Akio Asakura, un jeune homme de 18 ans qui s'apprête à finir sa dernière année d'étude au lycée.Comme on le découvre très vite, il est passionné par les voitures, et plus particulièrement par les séries Z de Nissan. On retrouve Akio au volant d'une Nissan 300ZX Z31 accompagné par ses amis. C'est alors qu'ils rencontrent "Black Bird", une Porsche 911 noire dont la réputation semble ne plus être à faire. Akio s'engage dans un défi qui s'avèrera malheureusement perdu d'avance Un flashback nous montre la source de l'attraction d'Akio pour les Nissan Z. Quelques années plus tôt, il avait aperçu une Nissan 240Z (plus couramment appelé Fairlady Z au Japon) a l'intérieur de laquelle se trouvait une jeune fille. Qui de la voiture ou de la jeune fille a le plus attiré l'attention d'Akio ? De retour dans le présent, Akio est averti par l'un de ses amis qu'une Nissan Z vient d'arriver dans la casse de leur ville. A peine a-t-il posé les yeux sur cette voiture qu'il éprouve un choc au fond de lui, comme si la voiture l'appelait. C'est elle, la Devil Z qu'il a toujours cherché, et malgré les avertissements du propriétaire de la casse sur la nature "maudite" de cette voiture, il décide de la prendre.

Après une longue pause, après la défaite de toutes les équipes de course de la préfecture, tout se résume à une dernière course. Takumi Fujiwara n'a jamais perdu une course, mais lorsque son adversaire utilise également une AE86, cela se transforme en une bataille de l'AE86. Le Projet D réussira-t-il dans la course finale et la plus difficile d'Initial D ?

L'équipe parcourt la région, défiant d'autres équipes et publiant les résultats des batailles sur leur site web. Chaque course est destinée par Ryosuke à développer un domaine spécifique des compétences de ses pilotes. À ce moment-là, Takumi mûrit lentement pour devenir un pilote de course de rue plus confiant et plus compétent, tandis que Keisuke améliore ses compétences techniques de conduite. Takumi développe instinctivement de nombreuses nouvelles techniques par sa propre ingéniosité après quelques incitations de Ryosuke, comme "l'attaque aveugle", un dépassement avec les phares éteints afin que son adversaire ne puisse pas le voir arriver et le bloquer, et l'utilisation du transfert de poids pour exécuter des manœuvres similaires à la technique du crochet de gouttière sur Akina.

Au Mont Akina, les courses entre pilotes chevronnés ne cessent de se dérouler tous les week-ends. Mais l'équipe locale des Speedstars semble dépassée par l'arrivée massive de stars du volant. Devant l'impossibilité de relever un défi qui leur est proposé, une seule solution apparaît : faire confiance la légende urbaine qui court sur un mystérieux pilote local qui dévale la montagne à toute allure. Personne n'irait alors soupçonner Takumi Fujiwara, un lycéen de dix-huit ans assez rêveur et ne connaissant rien aux voitures, d'être ce génie du volant. Le jeune homme ne fait que livrer le tofu familial dans la région... Par conséquent, il connaît les routes du coin par coeur qu'il aborde au volant de sa Trueno 86, une vieille voiture encore performante... à une vitesse hallucinante.