2016 : Tokyo est ravagé par l'effondrement d'une centrale nucléaire. 20 ans plus tard, la ville est quasiment déserte et Ibara, Aoi et Taeko, trois lycéennes modifiées génétiquement pour être insensibles aux rayonnements radioactifs, sont envoyées par l'armée dans la capitale pour trouver et secourir d'éventuels survivants.

Kaede Komura, un collégien un peu timide, aime en secret sa camarade de classe assise à côté de lui, Ai Mie. Il cherche sans cesse son regard à travers ses lunettes qu’elle a tendance à oublier très souvent ! Résolu à lui adresser plus souvent la parole, Komura cherche à se rapprocher d’elle en devenant son plus grand soutien…

Kuroh et Neko sont toujours persuadés que Yashiro est toujours vivant. Tandis qu’ils tentent de découvrir ce qu’il est advenu de lui, Reisi Munakata, le Roi bleu du clan « Scepter 4 », tente toujours de faire le deuil de son ami Mikoto, et Anna, la nouvelle Reine rouge du clan « HOMRA », bat le rappel de ses anciens camarades dispersés. De leur côté, le Roi vert et les membres de son clan « Jungle » repassent à l’action…

Teppei Arima est un étudiant de deuxième année au lycée. Sa famille tient un petit restaurant de rue, ce qui leur permet de vivre confortablement. Malheureusement, lors d'un jour des plus ensoleillés, ses parents meurent dans un accident de voiture. Quelques mois plus tard, il est contacté par son grand-père, Isshin Arima, un riche millionnaire, qui décide de lui léguer toute sa fortune. Teppei doit alors intégrer le monde des riches, monde qu'il détestait jusqu'alors...

L’école Osai était un établissement réservé qu’aux filles mais ne l’est plus depuis quelque temps, le corps étudiant est maintenant composé de 524 filles et de 28 garçons. Takatoshi Tsuda est forcé à devenir le vice-président du conseil des étudiants dans lequel il est le seul garçon au milieu d’un groupe de filles.

L’école Osai était un établissement réservé qu’aux filles mais ne l’est plus depuis quelque temps, le corps étudiant est maintenant composé de 524 filles et de 28 garçons. Takatoshi Tsuda est forcé à devenir le vice-président du conseil des étudiants dans lequel il est le seul garçon au milieu d’un groupe de filles.

L’école Osai était un établissement réservé qu’aux filles mais ne l’est plus depuis quelque temps, le corps étudiant est maintenant composé de 524 filles et de 28 garçons. Takatoshi Tsuda est forcé à devenir le vice-président du conseil des étudiants dans lequel il est le seul garçon au milieu d’un groupe de filles.

Des factions s’affrontant à l’aide de pouvoirs psychiques ont consolidé leur emprise sur les hautes sphères du Japon. Au nombre de sept, ces clans sont chacun guidés par un leader charismatique et ultra puissant baptisé « Roi ». Longtemps déchiré par ces guerres claniques, le Japon connaît à présent une période de calme. C’est dans cette paix de façade qu’un membre de la HOMRA, le clan rouge, est sauvagement assassiné. La vidéo de sécurité prise sur les lieux du crime accuse Yashiro Isana, un étudiant lambda qui ne semble appartenir à aucun gang. Mikoto Suô, le redoutable Roi rouge, décide de lancer ses hommes à la poursuite du jeune étudiant. Mais Reishi Munakata, le Roi bleu à la tête du « Sceptre 4 », ne compte pas laisser la HOMRA se faire justice en toute impunité… Mais qui est donc Yashiro Isana, l’homme sur le point de faire voler la paix en éclats ?

Osaka, AD20XX. Dans la dimension ziggourat, les Hand Shakers sont des êtres détenant un pouvoir psychique qu’ils activent en joignant leurs mains, mais ils ne peuvent pas utiliser cette arme sans être une paire. Une série d’affrontements a commencé et seul le duo le plus puissant pourra prétendre défier Dieu lui-même…