Un ex-flic, qui a été faussement accusé d'un crime, s'échappe sous les tropiques de l'extrême-nord du Queensland. Il propose ses services au sein d'une agence d'investigation privée nouvellement créée.

Dans ce nouveau chapitre explosif, la lutte entre les survivants et les aliens atteint un nouveau tournant quand un phénomène étrange s’empare de la population à travers le monde. Les survivants devront unir leurs forces pour empêcher une nouvelle catastrophe planétaire et sauver l’humanité.

Le cinéaste Oliver Stone revient sur les documents utilisés pour le tournage du film JFK, ainsi que sur d'autres documents qui ont été découverts depuis et revisite les zones d'ombre qui entourent la présidence et la mort tragique de John Kennedy.

Lorsque les humains découvrent que les aliens ont un ADN commun, ils peuvent affronter les aliens à armes égales pour reprendre le contrôle de la planète.

Alors que des scientifiques détectent une transmission venue d'une autre galaxie, ces derniers n'imaginent pas un instant que l'humanité est en péril. Pourtant, quelques jours plus tard, une invasion extraterrestre détruit le monde. Seuls quelques humains tentent de survivre dans un univers totalement déserté...