Naruto a causé trop de troubles, après une tentative d’assassinat sur le Raikage, il est enfermé dans une prison d’où l’on ne s’échappe pas. Elle a pour nom Hôzuki. Le maître des lieux s’appelle Mui, il utilise une technique de ninjutsu spéciale : l’Entrave Céleste, qu’il appose à tous les prisonniers. Cela les empêche de malaxer leur chakra et les rend impuissants. En prison, Naruto rencontre un ninja nommé Ryûzetsu qui lui parle de la Boîte du Paradis, une boîte légendaire qui date de l’époque de l’Ermite Rikûdo, et que Mui convoite. Elle aurait le pouvoir d’exaucer tous les voeux, et il semblerait que Mui ait besoin de Naruto pour l’ouvrir. Mais dans quel but ? Une chose est certaine, quelque chose ne tourne pas rond dans cette histoire…

Au lendemain de l'attaque du village, Naruto et Sakura sont choqués de découvrir que Danzo a été choisi comme nouveau Hokage. Et son premier ordre du jour concerne le ninja rebelle de l'équipe 7, Sasuke ! Ensuite, les Kage de chaque village se réunissent pour un sommet au Pays du Fer, et Naruto demande le pardon pour Sasuke au Raikage. Mais le cycle de la haine est profond dans le monde des shinobis, et tandis que les cinq Kage discutent de la façon de traiter l'Akatsuki, le mystérieux Madara s'avance et révèle des vérités qui vont bouleverser le monde de Naruto ! De plus, remontez le temps jusqu'à un tournant dans la vie du jeune Kakashi, alors qu'il se bat aux côtés de ses coéquipiers sous la direction du quatrième Hokage !

Naruto déclare à ses amis son intention de s'attaquer seul à Sasuke, tandis que les doyens de la Feuille prennent une décision sérieuse quant à l'identité de celui qui occupera le siège vacant de Hokage : Kakashi ! Au Mont Myoboku, Gerotora, Fukasaku et le Grand Seigneur doyen débattent de l'opportunité de donner à Naruto la clé du Sceau du Tétragramme que Gerotora détient, un geste qui pourrait potentiellement libérer les Neuf Queues.

Alors que le Village de la Feuille se prépare à la guerre, chaque shinobi et chaque clan doit réfléchir au rôle qu'il jouera dans les batailles à venir. Alors que les camarades de Naruto cherchent à se former auprès de sources surprenantes, Naruto lui-même doit affronter à la fois sa plus grande faiblesse et sa plus grande force : le renard à neuf queues. Pour atteindre une puissance optimale, Naruto doit apprendre à contrôler la bête qui est en lui, il demande donc de l'aide à la seule personne qui a maîtrisé cela, Killer Bee ! Mais le Jinchuriki à huit queues ne veut rien savoir de l'entraînement de Naruto !

La quatrième grande guerre ninja fait rage, et le danger vient de toutes parts. De vieux camarades et ennemis sont sortis de leur tombe sous le contrôle de Kabuto pour combattre les forces alliées. Alors que certains gardent leur calme, d'autres doivent lutter contre leurs émotions. L'entraînement de Naruto l'a rendu plus puissant, mais certains pensent que sa possession des neuf queues fait de lui un danger. Pendant ce temps, Sakura et le Ninja médical font face à un danger unique, car un ennemi pourrait se trouver parmi eux derrière les lignes alliées. Les forces alliées pourront-elles survivre aux assassins et à leurs amis ressuscités pour gagner la guerre ?

Gaara mène la Quatrième Compagnie au combat contre les précédents Kage, dont son propre père. Pendant ce temps, Naruto et Killer Bee font face à Itachi Uchiha ressuscité, qui reconnaît la progression de Naruto en tant que shinobi et son potentiel pour sauver son frère, Sasuke, de son chemin vers la vengeance. Les batailles font rage, et tous doivent affronter des ennemis - ainsi que des amis - qu'ils ne s'attendaient pas à revoir !

Alors que la quatrième grande guerre ninja fait rage, les vagues incessantes de Shinobi ressuscités font des ravages et les forces shinobi alliées sont obligées de continuer à combattre leurs propres amis et camarades tombés au combat. Pendant ce temps, Naruto approfondit sa compréhension de la stratégie de guerre, apprenant à sentir le Zetsu Blanc déguisé qui sème la confusion et la méfiance parmi les forces alliées. Mais tous les efforts et la douleur ne sont pas vains, car Gaara et Ohnoki sont plus près que jamais de découvrir qui est vraiment derrière ce conflit dévastateur. De plus, nous aurons un aperçu du parcours d'entraînement de Naruto avec Jiraiya, et nous rejoindrons la première équipe 7 pour une mission à l'époque où Sasuke en faisait encore partie !

Des années avant de devenir le professeur de Naruto, Kakashi était membre de l'équipe d'intervention de l'ANBU, si impitoyable qu'il a gagné le surnom de "Kakashi au sang froid". Mais malgré sa réputation, il est hanté par la mort de ses amis les plus proches lors de la troisième grande guerre ninja. Alors qu'il lutte contre cette perte, Kakashi doit découvrir qui est à l'origine d'expériences génétiques illégales, survivre aux menaces au sein de sa propre organisation, échapper à la capture par les partisans d'Orochimaru et combattre un jeune shinobi qui possède un redoutable et très rare Jutsu de style bois. Et après ces épreuves, un autre jeune ninja rejoint son unité : Itachi Uchiha !

Avec Kakashi incapable de se rendre jusqu'à Obito, Naruto bondit à la défense de son Sensei. La libération de Ten Tails force les forces shinobi alliées à lancer un assaut contre Obito et Madara, mais la puissante bête à queue s'avère être un ennemi redoutable. La situation est grave, mais les paroles d'Hinata incitent Naruto à poursuivre le combat avec une énergie renouvelée, tandis que l'aide arrive d'endroits inattendus - y compris un vieil adversaire ! Naruto et les efforts des shinobis alliés seront-ils suffisants pour éviter la destruction ?

Dans le même camp une fois de plus, Naruto et Sasuke se préparent au combat alors qu'Obito absorbe le pouvoir des Dix Queues pour devenir le Jinchuriki de la bête à queue. Alors que les autres shinobis assistent impuissants à la scène, Obito invoque l'Arbre Divin et commence à absorber leur chakra pour se préparer à exécuter le Tsukuyomi Infini. Naruto et ses amis doivent rallier leurs alliés désespérés pour vaincre Obito. Mais la bataille finale sera-t-elle vraiment physique - ou sera-t-elle une épreuve de volonté ?

Naruto et les shinobis alliés réussissent à extraire les bêtes à queue d'Obito, laissant Madara comme dernier ennemi à vaincre. Obito se rend compte de son erreur, mais le Zetsu noir l'empêche d'intervenir. La Bête à neuf queues est extraite de Naruto, et lui et Sasuke sont laissés près de la mort. Au milieu de tout cela, l'histoire mouvementée du clan Hyuga et les événements qui se sont déroulés dans le Village de la Feuille pendant que Naruto s'entraînait avec Jiraya sont révélés !

Alors que Naruto et Sasuke sont au bord de la mort, Kakashi et un Obito repenti se préparent à affronter Madara ensemble. Mais Madara a acquis le pouvoir des Six Chemins, et Gai devra peut-être faire le sacrifice ultime et ouvrir la Porte de la Mort afin de le combattre. Mais même cela pourrait ne pas être suffisant lorsque Madara activera le Tsukuyomi Infini, piégeant tout le monde dans un monde de rêve. Cet incroyable pouvoir peut-il être brisé ?

À peine revenus de leur mission de Suna, Naruto et Sakura accompagnés cette fois de Yamato et de Sai, partent à la rencontre de l’espion de Sasori. Ce dernier n'est autre que Kabuto. Mais une autre surprise les attend : la présence d’Orochimaru. Un combat titanesque s’engage alors entre Naruto et lui. Il se solde par l’intervention de Yamato et la retraite d’Orichimaru suivi mystérieusement par Sai. Grâce à son clone, Yamato et son équipe parviennent à les suivre jusqu'à tomber sur Sasuke... Quelle sera l’issue de ces retrouvailles tant attendues ?

Naruto est de retour !! Après trois ans d'entraînement avec Jiraya, il retrouve ses camarades de l'Académie Ninja ainsi que ses professeurs à Konoha. Tous ont évolué, y compris les ninjas du village de Suna. Seul Kakashi semble être resté fidèle à lui-même ! Hélas, les retrouvailles sont de courte durée. Gaara, devenu depuis peu Kazekage de son village est menacé par l'Akatsuki. Konoha envoie ses 2 meilleures équipes pour leurs prêter main forte : celle de Gai et Kakashi. Leur mission ? Sauver Gaara des griffes de l'Akatsuki et les empêcher de délivrer le démon qui sommeille en lui. Malheureusement, prêts à tout pour mener à bien leur mission, l'Akatsuki envoie deux de ces éléments : Deidara et Sasori, qui parviennent à enlever le Kazekage... Naruto arrivera-t-il à sauver son ami ?

Naruto, Kakashi, Sakura et Lee sont envoyés en mission pour escorter un prince durant son voyage à travers le monde pour ensuite le ramener chez lui, au pays de la Lune. Étant un pays très riche, le prince n'hésite pas à acheter tout ce qu'il voit, et lors de son voyage il tombera sur un cirque qui possède un tigre à dents de sabre très rare et le prince veut le posséder à tout prix. Il achète alors le zoo entier. La mission de l'équipe 7 et Lee qui était de simplement protéger le prince se transforme en une mission pour protéger et le prince qui n'écoute personne et les animaux qu'il vient d'acheter. Mais ils parviennent malgré cela à rentrer au pays de la Lune, indemnes. Cependant, trois ninjas aux techniques terrifiantes les attendent.

Tout commence sur une plage près du village de Suna. Gaara et les ninjas du Sable sont confrontés à un mystérieux ennemi. Pendant ce temps, Naruto, Sakura et Shikamaru sont attaqués par le même ennemi lors d'une mission. Parmi eux se trouve un étrange garçon en armure, doté de grands pouvoirs. Retrouvés blessés par la caravane d'un peuple nomade, Naruto et le garçon nommé Temujin vont faire connaissance. Temujin appartient à un groupe idéaliste qui rêve de construire Utopia : un lieu où règne la paix et où le faible est protégé. Pour cela, Temujin est à la recherche d'une pierre mystérieuse, la Pierre de Guelel. Mais les apparences sont trompeuses...

Naruto, Sasuke et Sakura sont chargés d'escorter Yukie Fujikaze, une actrice célèbre, au pays des neiges, lieu de son prochain tournage. Mais Yukie n'est pas décidée à faire le voyage. Toujours courageuse à l'écran, l'actrice semble dissimuler de lourds secrets... Naruto et son équipe vont aider Yukie à affronter son destin et à renouer avec son passé.

Au plus profond du Village caché de la Feuille, le jeune ninja Naruto Uzumaki porte en lui l'esprit du renard à neuf queues, qui a failli détruire le village. Toujours exclu à cause de son secret, Naruto se bat maintenant aux côtés de ses coéquipiers Sasuke et Sakura pour se prouver à lui-même et à tous les autres qu'il est le plus grand ninja de tous les temps. Mais il a une longue liste de défis à relever avant d'y parvenir !

Avant la dernière épreuve de l'examen Chunin, Naruto reçoit un entraînement spécial du légendaire Sage des Crapauds, Jiraiya. Lorsque les combats reprennent, Naruto est prêt, mais qu'en est-il de Sasuke ? Il est sur le point d'affronter le seul ninja que personne, pas même Naruto, ne pense pouvoir battre. Mais au milieu de tout cela, un sinistre complot se met en place, et le Village Caché de la Feuille se retrouve attaqué !

Naruto revient de son voyage d'entraînement, impatient de voir son ami Sasuke. Mais Sasuke n'a qu'une seule chose en tête : sa quête de vengeance contre son frère aîné. Sa soif inextinguible de pouvoir ne connaît aucune limite, et il est bientôt attiré hors du Village de la Feuille par les sbires d'Orochimaru, les Quatre du Son. Déterminés à le récupérer, Shikamaru et Naruto forment une équipe composée des meilleurs genins du village pour le retrouver, et la chasse commence !

Dans le Village Caché de la Feuille, il y a peu de choses que Naruto et Choji aiment plus qu'un bol fumant de ramen de chez Ichiraku, et quand la fille du propriétaire est kidnappée, ils se mettent sur l'affaire. Ensuite, les missions des ninjas de la Feuille les mènent à la recherche d'une météorite et protéger une princesse. Quand un ninja maléfique qui en veut à la princesse se met en travers de leur chemin, c'est la vie de Naruto qui est en jeu !

Ichiro Sato, 17 ans, est un adolescent banal qui va connaître une drôle de relation avec sa professeur, mademoiselle Kana Kojima.

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Quatre hommes sont transférés à Nanba, la prison réputée la plus sécurisée au monde. Jûgo n’a aucun souvenir de ses méfaits. Il a déjà cherché à s’évader et a écopé d’une rallonge de peine. Uno a quant à lui escroqué de nombreuses femmes. Rock ne vit que pour la bagarre. Enfin, Nico est un fan… d’animés !

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Quatre hommes sont transférés à Nanba, la prison réputée la plus sécurisée au monde. Jûgo n’a aucun souvenir de ses méfaits. Il a déjà cherché à s’évader et a écopé d’une rallonge de peine. Uno a quant à lui escroqué de nombreuses femmes. Rock ne vit que pour la bagarre. Enfin, Nico est un fan… d’animés !

Les "7 Péchés Capitaux" ont quitté les Enfers et étendent leurs pouvoirs et leurs fléaux sur Terre. Le Paradis est en proie aux chaos et les Anges appartenant aux "7 Vertus Célestes" sont donc envoyés sur Terre afin de chercher un candidat pouvant devenir le "Vrai Messie" et donc sauver la Terre.

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En plein cœur de l'océan Pacifique a été construite artificiellement l'ile Nanaejima dont le but est d'accueillir des élèves de tout niveaux en leur donnant les moyens d'exploiter leur plein potentiel. Contraint de quitter le cocon familial, Yama Juugo va y poursuivre ses études après avoir trouvé un appartement à un prix abordable. Toutefois, il découvre que le lieu est « hanté » par le fantôme de Nanana, une adolescente assassinée il y a dix ans de cela sans que l'on ne connaisse l'identité du meurtrier. Grande aventurière, cette dernière avait découvert des trésors d'une valeur inestimable qu'elle a caché à différents endroits de l'île. Avec l'intention de lever le mystère sur sa mort, Juugo décide de retrouver tous les trésors dans l'espoir que ces derniers lui fourniront de précieux indices.

Deux jeunes femmes se rencontrent dans le train les conduisant à Tokyo. L'une va rejoindre son petit ami tandis que l'autre veut devenir chanteuse professionnelle. Leur destination n'est pas leur seul point commun car elles ont le même âge (20 ans), mais aussi le même prénom : Nana. Elles se séparent finalement à la descente du train. Plus tard, elles se retrouvent par hasard, alors qu'elles cherchaient toutes les deux un appartement. Trouvant avantageux de partager les frais de loyer, elles décident de vivre en colocation dans l'appartement 707 (c'est une autre coïncidence car leur prénom, Nana, représente le chiffre 7 en japonais). Aussi différentes d'apparence que de caractère, Nana Ōsaki et Nana Komatsu vont se lier d'une profonde et fusionnelle amitié, se complétant et se soutenant mutuellement à travers les différentes épreuves qu'elles seront amenées à traverser.

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Nagi no Asukara raconte l'histoire de deux collégiens : Manaka Mukaido et Hikari Sakishima. Manaka est une pleurnicheuse de première et Hikari, son ami d'enfance, passe son temps à prendre soin d'elle. Ils ont cependant une petite particularité : ce sont des humains vivant au fond de la mer. Eux et leurs amis, Chisaki et Kaname, s'apprêtent désormais à intégrer le collège à la surface de la terre.