Mikael Blomkvist est journaliste économique dans le magazine Millenium. Condamné pour diffamation, il décide de prendre de la distance avec sa vie et son métier. Mais Henrik Vanger, grande figure de l'industrie suédoise, fait appel à lui afin d'enquêter sur une disparition non élucidée, celui d'Harriet Vanger, nièce du grand homme et disparue à l'âge de seize ans. Au cours de ses recherches, Blomkvist se rend compte que La famille Vanger semble cacher bien des haines et des secrets. Dans le cadre de son enquête, le journaliste est amené à rencontrer Lisbeth Salander. La jeune femme de vingt-quatre ans possède un don exceptionnel, celui de découvrir des informations introuvables. Tous deux vont être amenés à se croiser dans une enquête qui va révéler beaucoup plus que ce que chacun aurait pu imaginer...

L'histoire se déroule à Stockholm en 2021 et suit l'histoire d'amour entre Elisabeth et John. Les deux jeunes ont grandi dans la même ville, mais vivent toujours à des années-lumière l'un de l'autre, séparés économiquement, socialement et culturellement. Jusqu'au jour où ils commencent dans la même classe de lycée.

Entre malentendus et tentations diverses, la relation autrefois passionnée d'un couple se délite peu à peu. Une histoire racontée à travers des dioramas désopilants.