Dans cette version contemporaine de Fantasia, Fantasia 2000 prolonge la vision de Walt Disney en alliant des musiques classiques et des techniques d'animation d'images plus récentes. On retrouve « L’Apprenti Sorcier » ainsi que 7 nouvelles séquences, dont « Les Pins de Rome », « Le Carnaval des Animaux », « Pomp and Circumstance » et « Rhapsody in Blue ».

Pour se protéger d'un orage, le timide Richard Tyler pénètre dans une bibliothèque déserte et se retrouve entrainé dans un univers animé et féerique. Dans ce monde étonnant et plein de surprises, les personnages légendaires des classiques de la littérature prennent vie. Richard fait la connaissance du tristement célèbre Dr Jekyll et M. Hyde, rencontre la colossale Moby Dick, côtoie les fourbes pirates de L'Île au trésor et affronte un gigantesque dragon cracheur de flammes. Guidé par un trio de livres parlants - l'Aventure, la Fantaisie et l'Horreur -, Richard doit vraiment vaincre ses pires craintes s'il espère revenir dans son monde.