Ren et sa mère Ethel quittent Chicago pour Beaumont, une petite ville du Middle West. Passionné de rock et danseur effréné, Ren heurte les conceptions morales de la communauté et de son pasteur, maître à penser du lieu. Révoltés par cet univers sclérosant, les jeunes de la ville se rallient à Ren...

Au pied de la ville d’Orse s’étend l’abysse, une faille gigantesque à la profondeur inconnue habitée par d’étranges créatures et emplie d’antiques reliques. Depuis des années, ce gouffre attire de nombreux aventuriers séduits par l’aura de mystère qui l’entoure. On les appelle « les caverniers ». C’est ici que vit Rico, une jeune orpheline obsédée par l’Abysse et désirant marcher dans les traces de sa mère. Un jour, lors de ses prospections, elle découvre le corps inanimé d’un jeune garçon. Elle n’imagine alors pas à quel point cette découverte va changer sa vie et accélérer son destin...

Dean Youngblood, fils de fermier, trop jeune pour être hockeyeur professionnel mais fermement décidé a le devenir, fait son stage dans l'équipe Junior des "Hamitlon Mustangs". Un coup de crosse dans l'oeil lors d'un match lui fait arrêter la compétition. Le voila baptisé pour une série d'épreuves qu'il surmontera...

Les années 1960, à New York, dans le Bronx. L'histoire décrit la vie quotidienne de jeunes qui se regroupent en bandes, chacune avec ses codes, vestimentaires ou physiques. Entre les rencontres avec les filles, les rivalités entre bandes, les problèmes ethniques, on découvre la vie de ces jeunes qui vont bientôt faire leurs premiers pas dans la vie d'adultes.

En 2074, une entreprise crée une femme-robot pour infiltrer les entreprises rivales grâce à ses charmes et ensuite se transformer en bombe. Mais, celle-ci commence à avoir des sentiments et tombe amoureuse d'un militaire spécialiste en arts martiaux.

Jimmy Kristidis est obsédé par le fait d'être un grand joueur de football. Pour ce faire, il décide de rencontrer Pelé afin qu'il l'entraîne et le conseille pour devenir, comme lui, le meilleur footballeur de tous les temps...

Directement après les événements du film « Made in Abyss Movie 3: Dawn of the Deep Soul » cette saison de Made in Abyss couvre l'aventure de Reg, Riko et Nanachi au 6ème palier, la capitale des non-retournés.