Le lycéen Yuichi Katagiri place l’amitié au-dessus de tout ! Il a une vie épanouie avec ses amis Shiho Sawaragi, Tenji Mikasa, Makoto Shibe et Yutori Kokorogi. Cependant, un incident les entraîne dans un jeu dans lequel ils doivent rembourser une énorme dette. La seule façon de gagner le "Tomodachi Game", c’est de ne jamais douter de ses proches. Mais leur amitié va être mise à rude épreuve… Vont-ils se faire confiance ou se trahir entre-eux ?

Dans une école bâtie sur une île perdue au beau milieu de l'océan... De jeunes gens doués de super-pouvoirs, les Prodiges, suivent un entraînement intensif qui doit les aider à affronter une terrible menace appelée "les ennemis de l'humanité". Une nouvelle élève débarque parmi eux, Nana, et se prétend capable de lire dans les pensées des gens. Un jour, elle reçoit un SMS : pour épargner des millions de vies, elle doit assassiner un de ses camarades... Derrière cette jeune fille a priori inoffensive se cacherait-il une redoutable meurtrière de super-héros ?