Dans le monde de l'espionnage, certaines missions exigent un agent doté d'un ensemble unique de compétences, possédant non seulement de la bravoure mais aussi la capacité de faire fondre même le cœur le plus méchant. C'est le travail de C.I. Ape ! Le tout premier chimpanzé à rejoindre la C.I.A.

Des amis de toujours, Scott et Emily, sont chez la grand-mère de Scott lorsqu'ils découvrent, dans une pièce secrète, une mystérieuse créature nommée Rufus accompagnée du sorcier Abbot. Ils ont pour mission de sauver leur monde magique. A l'aide d'un ancien livre de sorts, ils rassemblent des ingrédients pour créer une poussière magique qui les aidera à sauver leur monde qui se meurt. Au cours de leur voyage, ils rencontreront trois serviteurs malveillants aux pouvoirs maléfiques qui cherchent à mettre la main sur ce livre pensant qu’ils pourront alors tout transformer en or.