Au XVème siècle, dans l'ancienne Tallinn, le jeune apothicaire Melchior est connu pour son esprit éclairé et son ingéniosité. Après le meurtre sauvage d’un haut responsable de l'Ordre des chevaliers teutoniques retrouvé décapité, le commandant de la garnison lui confie la tâche de débusquer l’assassin. Sans lien apparent, le prieur du monastère meurt empoisonné quelques jours plus tard. Alors que le mystère s’épaissit, Melchior est encore loin de soupçonner que son enquête va le mener sur la trace d'un des secrets les mieux gardés de l'église catholique.

Un dangereux triangle amoureux formé par Sergey, un conscrit, son amie charmante et ambitieuse Luisa, secrétaire du commandant de la base, et Roman, un jeune pilote audacieux de l'armée de l'air soviétique. Ils risquent leur liberté et leur vie face à une enquête du KGB qui s'intensifie à leur égard...