Monsieur Méchant, membre notoire de la Ligue du Mal, une organisation qui projette d’envahir la Terre, se bat au quotidien contre les Rangers qui la défendent. Enfin, sauf aujourd’hui, car il est bel et bien décidé à profiter de son jour de congé. Pourquoi ne pas se rendre au zoo pour admirer les pandas, ou dans une supérette pour acheter de la glace ?

Ruka, jeune collégienne, vit avec sa mère, avec qui elle ne s’entend pas toujours très bien. Elle se consacre à sa passion du handball. Hélas, elle se fait injustement exclure de son équipe le 1er jour des vacances. Furieuse et désoeuvrée, elle erre dans la ville et décide de rendre visite à son père à l’aquarium où il travaille . Elle y rencontre un étrange garçon, Umi...

La série se déroule dans la ville futuriste de Gōha et met en scène Yūga Ōdō, un élève de CM2, qui aime à la fois les inventions et les duels. Estimant que les règles actuelles du jeu de cartes Duel Monsters sont trop étouffantes, Yūga réussit à installer un nouvel ensemble de règles de sa propre création, connu sous le nom de « Rush Duel », permettant des duels plus rapides et plus frénétiques. Yūga et ses amis nous partagent les joies des Rush Duels sous l'œil attentif de la Gōha Corporation qui supervise la ville.