Alors que le rôle d'informateur du FBI de Reddington est révélé, d'anciens Blacklistés s'unissent dans un désir mortel de vengeance, le mettant lui et le reste de l'équipe à rude épreuve.

Deux ans après la mort d'Elizabeth Keen et la dissolution de l'unité, Red et les anciens membres de l'équipe se voient obligés de reprendre du service. Ils affronteront des adversaires mortels, des complots inimaginables et des trahisons surprenantes qui menaceront les alliances et stimuleront la vengeance du passé, dirigés par le criminel le plus sournois de tous : Reddington lui-même.

Dos au mur, Raymond Reddington affronte son ennemi le plus redoutable : Elizabeth Keen. De connivence avec sa mère, la tristement célèbre espionne russe Katarina Rostova, Liz doit décider jusqu'où elle est prête à aller pour découvrir pourquoi Reddington est entré dans sa vie et ce qu'est vraiment son but final. Les retombées entre Reddington et Keen auront des conséquences dévastatrices pour tous ceux qui se trouvent dans leur sillage, y compris la Task Force qu'ils ont aidé à créer.

Après avoir été enlevé par Katarina Rostova, Raymond « Red » Reddington se retrouve seul en territoire hostile, ne sachant pas à qui il peut faire confiance. Entouré d'anciens ennemis et de nouveaux alliés, Red doit garder une longueur d'avance sur le criminel le plus dangereux de la liste noire, qui ne recule devant rien pour découvrir la vérité que Red ne veut pas que quiconque connaisse.

Toujours sous le choc après avoir appris que Red est un imposteur, Liz et Jennifer tentent de savoir ce qui est arrivé à leur père biologique. Face à la maison d'enfance des deux jeunes femmes, Liz se remémore un souvenir effrayant. Pendant ce temps, Reddington conduit le FBI sur la piste du chirurgien des criminels, Hans Koehler. Mais un événement va placer Red entre les barreaux. Parviendra-t-il à s'en sortir ? De leur côté, Liz et son équipe affrontent un terroriste coriace et dangereux surnommé " Le Corse ".

Red est ruiné, et son empire est aujourd’hui décimé. Il vit désormais dans un motel et survit en dérobant des voitures de luxe pour les revendre. Au siège du FBI, Harold annonce à son équipe que Reddignton est le père de Liz. La nouvelle suscite bien des commentaires et des doutes, mais Harold soutient sa protégée. Pourtant, cette dernière est bien loin de connaître la sombre identité de son père. Elle ignore également ce que renferme cette mystérieuse valise que Tom vient secrètement de récupérer dans le casier d’une gare, et laissée à son attention par Kaplan avant sa disparition. A qui appartiennent les os qui y sont enfermés ? Comment trouver l’identité du corps ?

Trahi par Kaplan, Red n’a plus qu’une idée en tête : sauver Liz. Pendant ce temps, au siège du FBI, la nouvelle concernant Keen fait l’effet d’une bombe. Ébranlés, ses collègues cherchent à comprendre les raisons qui l’ont poussée à simuler sa propre mort et à leur mentir. Entre soulagement et colère, Harold demande à Ressler d’intervenir à Cuba pour retrouver Liz et sa famille. De son côté, Kirk essaie de justifier ses actions auprès d’Elizabeth tandis que la jeune femme refuse de croire en leurs liens de sang. Jusqu’où Reddington ira-t-il pour libérer Liz et Agnès des griffes de Kirk ? Liz obtiendra-t-elle enfin les réponses qu’elle attend depuis si longtemps sur son énigmatique passé ?

Traquée par le FBI après être devenue le bouc émissaire de la Cabale, Liz est l’une des fugitives les plus recherchées des États-Unis et se trouve contrainte de fuir avec Red. Tandis qu’Harold Cooper est sous le coup d’une enquête, c’est Donald Ressler qui dirige le FBI et mène une chasse à l’homme de grande ampleur contre Liz et Red. Plus dangereux ensemble que séparément, ils devront tout faire pour garder une longueur d'avance sur leurs anciens collègues.

Red continue d’aider le FBI à arrêter des malfaiteurs et des criminels, tout en poursuivant sa guerre contre Berlin, son ennemi juré. Alors qu'un personnage clé de son passé refait surface, Red doit affronter un ennemi mortel, pendant que Liz s'intéresse à une affaire de blanchiment d'argent.

Pendant des années, l’ancien agent du gouvernement Raymond Reddington fut l’un des fugitifs les plus recherchés aux États-Unis. En contact avec des criminels du monde entier, Red avait acquis le surnom de "concierge du crime". Mais aujourd’hui, il s’est mystérieusement rendu au FBI avec une proposition intrigante : les aider à arrêter les plus grands criminels au monde, à la condition de ne traiter qu’avec Elizabeth Keen, une profileuse du FBI fraîchement sortie de l’académie.