Lorsqu’une épidémie de grippe canine envahit la ville japonaise de Megasaki et menace de contaminer les hommes, le maire ordonne la mise en quarantaine de tous les chiens. L’île poubelle devient : l’Île aux Chiens. Un jeune garçon de 12 ans, Atari, se rend sur place à la recherche de son chien perdu, Spots. C’est alors qu’il fait la découverte, à l’aide d’une meute de cinq chiens, d’une conspiration qui menace la ville.

Chihiro, 10 ans, a tout d’une petite fille capricieuse. Elle s’apprête à emménager avec ses parents dans une nouvelle demeure. Sur la route, la petite famille se retrouve face à un immense bâtiment rouge au centre duquel s’ouvre un long tunnel. De l’autre côté du passage se dresse une ville fantôme. Les parents découvrent dans un restaurant désert de nombreux mets succulents et ne tardent pas à se jeter dessus. Ils se retrouvent alors transformés en cochons. Prise de panique, Chihiro s’enfuit et se dématérialise progressivement. L’énigmatique Haku se charge de lui expliquer le fonctionnement de l’univers dans lequel elle vient de pénétrer. Pour sauver ses parents, la fillette va devoir faire face à la terrible sorcière Yubaba, qui arbore les traits d’une harpie méphistophélique.

Amon est un jeune garçon pas tout à fait comme les autres. En effet celui-ci est doté de pouvoirs exceptionnels mais inexplicables. Il va par la suite se prêter volontairement aux expériences de son père physicien qui cherche avant tout à faire progresser la science. Mais malheureusement Branick va faire son apparition. C'est un homme mauvais qui convoite la mystérieuse force d'Amon afin de l'exploiter dans la fabrication d'une bombe destructrice dans le but de dominer le monde. Par peur, le scientifique abandonne toutes ses recherches et choisit de s'enfuir avec sa femme et son fils. Mais durant leur fuites de nombreux problèmes surviennent. Le scientifique et sa femme réussissent malgré les ennuies à s'enfuir laissant derrière eux Amon seul devant ses responsabilités...

L'artiste manga "Shinji Izumoto" a obtenu un contrat pour un film. Il aurait dû faire la fête, mais il devient aveugle, sa série de mangas a été annulée et il ne peut plus s'occuper de sa grand-mère. Tout seul, Shinji prend la décision dévastatrice de sauter d'un balcon. Lorsque "Hibiki Aida", un de ses fans sourds, sauve Shinji, ils commencent une vie inhabituelle ensemble.

Matofuji lance son assaut contre le château du Seigneur Satomi.

Paul Racine est un puissant homme d'affaires informaticien. Un soir, il séduit une belle mystérieuse japonaise, Kirina, à Nagoya au Japon. Quelques minutes après qu'il ait quitté sa chambre, trois ninjas s'introduisent chez la jeune femme. Leur chef, le légendaire Kinjo, dont seule une poignée de fidèles connaît l'identité, annonce à Kirina qu'elle doit mourir pour avoir trahi son protecteur. Racine assiste impuissant à l'exécution et entrevoit le visage de Kinjo. Il devient la cible des assassins et pour survivre, il doit s'associer à l'illustre professeur d'arts martiaux Takeda et sa femme Mieko qui lui offrent de se réfugier sur leur île. Racine découvre alors un autre monde, régi par les codes traditionnels des samouraïs et leurs conception médiévales du courage et de l'honneur. Il découvre aussi que Takeda s'est servi de lui pour débusquer Kinjo, son rival de toujours…

L'histoire prend place dans le quartier d'Ikebukuro et se centre Mio et Shin, deux amis d'enfance. Mio est amoureuse de Shin et pense toujours à lui, mais n'a jamais pu lui avouer ce qu'elle ressent. Un jour, ils se disputent sur quelque chose de trivial, et quelque temps après, Mio décide de se réconcilier avec lui. En se rendant chez Shin, trempée par la pluie, elle est impliquée dans un accident de la circulation. Lorsque Mio reprend conscience, elle se retrouve dans un monde inconnu.

Yoshiwara, quartier des plaisirs et du divertissement de la capitale Edo, l'ancienne Tokyo. Réservé à l'élite de la société japonaise, ce quartier clos est la demeure des plus grandes courtisanes de l'époque : les Oïran. Elles font et défont les tendances et la mode de l'époque, et sont aussi enviées que détestées... Parmi elles, une femme, Kiyoha, va devenir une légende sous le nom de Higurashi...

Kazamatsuri, un Ronin vient de voler le sabre ornemental offert par le shogun au clan Nagashima qu'il était pourtant supposé garder. Le chef du clan décide donc d'envoyer son fils Heishiro à la poursuite du Ronin. Déterminés mais inexpérimentés, Heishiro et ses deux amis vont vite déchanter...

Jeanne part pour le Japon, à la recherche d'une plante médicinale rare. Lors de ce voyage, elle fait la connaissance de Tomo, un garde forestier, qui l’accompagne dans sa quête et la guide sur les traces de son passé. Il y a 20 ans, dans la forêt de Yoshino, Jeanne a vécu son premier amour.