Missionné par un programme international d'observation de la vie sous-marine, un submersible a été attaqué par une créature gigantesque qu'on croyait disparue. Sérieusement endommagé, il gît désormais dans une fosse, au plus profond de l'océan Pacifique, où son équipage est pris au piège. Il n'y a plus de temps à perdre : Jonas Taylor, sauveteur-plongeur expert des fonds marins, est engagé par un océanographe chinois particulièrement visionnaire, contre l'avis de sa fille Suyin.

Une exploration sous-marine dans les profondeurs de l'océan tourne au chaos lorsqu'une exploitation minière malveillante menace la mission et force l'équipe de recherche à se lancer dans une périlleuse bataille pour la survie.