Des super-héroïnes font équipe pour tenter de remporter un tournoi sportif intergalactique. Mais leurs opposantes se montrent prêtes à tout pour gagner…

La Justice League a disparu et les super-méchants envahissent Metropolis ! Il n'y a qu'une seule équipe qui peut résoudre ce mystère : Scooby-Doo et sa bande ! Mais attendez, ce n'est pas le seul chien de la ville : Krypto, le Superchien de Superman aux super pouvoirs est aussi sur le coup. Son aide ne sera pas de trop pour que Mystères associés arrive à débarrasser le quartier général de la Justice League des fantômes qui le hantent. Quant à Lex Luthor, est-il enfin revenu dans le droit chemin ? Ou est-il de mèche avec le Joker et Harley Quinn ? Les super-méchants de DC ont peut-être déjà affronté Superman, mais ils vont devoir faire face à quelque chose de tout nouveau : une bande de sales petits fouineurs !

Dans la série classique "Les 13 fantômes de Scooby-Doo", la bande a capturé 12 des 13 terrifiants fantômes. Mais qu'est-il arrivé au 13ème ? Avec leur ancien partenaire Vincent Van Ghoul, Scooby-Doo et ses amis se préparent pour attraper le dernier fantôme et fermer pour toujours le Coffre des Démons

Le Scooby-Gang flaire un objet étrange au milieu de Nowhere, au Kansas, la ville natale de Courage et de ses propriétaires, Eustace et Muriel Bagge. Bientôt, la mystérieuse découverte les met sur la piste d’une cigale géante et de ses guerriers ailés farfelus. Fred, Véra, Daphné et Sammy savent que ce mystère est trop gros pour eux. Ils auront besoin de l’aide du duo de chiens pour reconstituer le puzzle ! Scooby et Courage pourront-ils surmonter leurs peurs et vaincre l’armée d’insectes avant que le monde entier ne s’éteigne ?

Cherchant à laisser leur carrière d'enquêteur derrière eux, l'équipe de Scooby-doo part pour un voyage tous frais payés sur une mystérieuse - mais étrangement familière - île tropicale. Leur voyage va cependant prendre une nouvelle tournure dès lors qu'ils rencontrent les zombies qui peuplent l'île.