Un jour, Kogorô reçoit à l'agence un coup de téléphone. Au bout du fil, une personne qui lance un avertissement concernant l'explosion d'une bombe. À la fin du message, l'auteur laisse un code "Le Garçon en Bleu et Le Zèbre Bleu, La pluie venant d'en haut...". Si Conan arrive à déchiffrer ce code, il pourra stopper la bombe. C'est une nouvelle aventure qui commence pour Conan et les Détectives Boys. L'histoire prendra place dans un stade, lors d'une rencontre de foot entre l’équipe des Tôkyô Spirits, de Hideo Akagi, et celle des Big Ôsaka de Ryûsuke Higo.

La veille d'une sortie avec le professeur Agasa et les enfants, Conan fait un cauchemar où il voit Gin et Vodka le retrouver et s'en prendre à Ran. Pendant ce temps, une série de meurtres a lieu dans tout le Japon, incitant la police à collaborer entre préfectures. Le seul point commun entre eux est la présence d'une pièce de mah-jong à côté des victimes, ainsi que les derniers mots prononcés par la dernière victime en date : "Tanabata Kyo".

À bord d'un luxueux bateau, Conan et toute sa petite troupe au grand complet voguent au grès de cette paisible croisière. Bien évidement, un évènement viendra rapidement briser cette utopique félicité : le meurtre de l'un des passagers. Cet incident déclenchera une réaction en chaîne allant crescendo jusqu'à mettre en péril la vie des 600 passagers.

L'entourage de Kogoro Mouri est en danger ! Un ancien détenu, que notre détective a mis sous les verrous dans le passé, ressurgit et s'attaque aux proches de Mouri en commençant par l'inspecteur Megure et le professeur Agasa. Shinichi Kudo, alias Conan Edogawa, va devoir faire de tout son possible pour éviter toute victime et mettre rapidement un terme aux agissements de ce meurtrier. Parallèlement, Ran apprendra la raison pour laquelle son père a quitté la police et sa femme : Eri Kisaki.

Tout commence alors que Kogoro, Ran, Conan, les détectives Boys et Haibara sont invités à une soirée d'inauguration d'un jeu vidéo virtuel appelé "Cocoon". Sonoko dont le père a participé à l'élaboration du jeu est aussi présente. Lors de cette soirée, les enfants de ceux qui auront participé à la création du jeu pourront le tester. Conan reçoit le badge d'entrer à la démo par le professeur Agasa qui avait aussi participé à la création de Cocoon avec Yusaku Kudo, le père de Shinichi. A la grande surprise de Conan, les détectives Boys et Haibara ont réussi à obtenir des badges. Alors que tout les enfant sont sur le point d'entrer dans les capsules qui permettent d'entrer dans le jeu, Sonoko donne son badge à Ran pour que celle-ci accompagne Conan.

Le film se déroule à bord d'un vaisseau Aegis ultra sophistiqué, avec la coopération du Ministre japonais de la Défense et des Forces d'Autodéfense Maritime. On a retrouvé le cadavre d'un membre des Forces d'Autodéfense auquel il manquait le bras gauche, et on apprend qu'un espion a infiltré le vaisseau Aegis. Ran est mise en péril, si bien que Conan se voit obligé d'intervenir contre le dangereux "Espion X" ("Spy X").

2199. La galaxie a sombré dans la plus impitoyable des guerres. Les radiations ont rendu la terre inhabitable, et il n’y aura bientôt plus de refuge possible pour l’espèce humaine. Un seul vaisseau peut retrouver la machine de décontamination qui sauverait la Terre d’une extinction inévitable…

Sur le continent de Cruson, une guerre est sur le point d'éclater entre le Royaume de Kreeshna et la fédération d'Athnès. Terre dépourvue de carburant, une nouvelle technologie fut créée, mêlant magie et minéral : la manipulation du Quartz. Lygatt Arrow est un « impuissant ». Il ne peut contrôler le Quartz et par conséquent toute la technologie actuelle. Il se retrouve au cœur du conflit malgré lui.

Ranma Saotome, jeune expert en arts martiaux, n’est plus le même depuis qu’il est revenu d’un entraînement en Chine. Là-bas, il chutait avec son père Genma dans une source magique aux vertus mystèrieuses. Depuis, Ranma et son père sont victimes d’étranges métamorphoses au contact de l’eau froide. Soun Tendô, qui a arrangé le mariage de Ranma avec l’une de ses filles, est pour le moins sidéré lorsqu’il découvre que Ranma se révèle finalement être… une fille !

Dans un futur proche, l’humanité a réussi à dompter la technologie et bénéficie de tout le confort moderne. Mais un dernier enjeu pèse sur la société : le vieillissement de la population. Pour résoudre ce fléau grandissant, la médecine est remplacée par la robotique avec la création d’une machine nommée le « Z-001 », capable de prodiguer tous les soins nécessaires aux personnes âgées. Kijûrô Takazawa est le premier cobaye contraint à tester ce robot, bien que ce dernier aurait souhaité rester avec son ancienne infirmière, la jeune Haruko. L’expérimentation tourne mal et le Z-001 se transforme en arme de destruction massive.

MegaTokyo 2033 : Tokyo a été rasée à la suite d'un grand tremblement de terre. Une nouvelle ville, MegaTokyo, est alors recréée grâce à l'aide d'une entreprise multimillionnaire, Genom Corp. Genom a créé et produit en masse des créatures biomécaniques appelées Boomers pour aider à la restauration de MegaTokyo. Lorsque les Boomers ont commencé à devenir incontrôlables, l'ADPolice a d'abord tenté de les arrêter, mais ils se sont révélés bien plus difficiles à gérer qu'on ne l'avait imaginé. Face à la menace des Boomers, un groupe de quatre filles issues de différents milieux sociaux s'est constitué. Se faisant appeler les Knight Sabers, elles étaient les seules à avoir assez de puissance de feu et d'ingéniosité pour défendre MegaTokyo contre Genom et ses Boomers fous.

Lupin enquête sur une fausse carte de visite à son nom au cours d'une fête huppée. Un groupe d'assassins, la Tarentule, s'invite à la fête et assassine l'hôte. Zenigata, qui enquête aussi sur la carte, poursuit Lupin mais est blessé par un Walther P38 argenté. Lupin, apercevant l'arme familière, est déterminé à venger non seulement Zenigata, mais aussi un épisode de son passé.

À San Fransico, Californie, Lupin et sa bande tentent de trouver l'emplacement de quelques lingots d'or dans un navire coulé au large de l'île d'Alcatraz. Mais un groupe appelé "Society Seven" veut aussi ces lingots d'or. "Society Seven" est composée de sept dangereux criminels. Ils ont également un lien profond avec l'île d'Alcatraz et l'assassinat de feu le président John Fitzgerald Kennedy.

C'est l'histoire d'amour de Cha Dong-joo, un homme devenu sourd à la suite d'un accident mais qui prétend entendre, et de Bong Woo-ri, une femme intelligente mais qui fait semblant d'être idiote pour protéger la dignité de son père handicapé mental. Elle est à la recherche de son demi-frère, Bong Ma-roo, qui s'est enfui de chez lui il y a 16 ans.

Sur les autoroutes désertées d'une Australie méconnaissable, une guerre sans merci oppose motards hors-la-loi et policiers Interceptor, qui tentent de triompher de la vermine au volant de voitures aux moteurs surgonflés. Dans ce monde en pleine décadence, les bons, les méchants, le manichéisme disparaissent...

L'histoire se déroule dans un monde peuplé d'humains et d'êtres « divins », les Tenzokus. Ces derniers, qui sont invisibles pour la plupart des êtres humains, ont la capacité d'accorder leur bénédiction aux villes et villages et sont donc vénérés comme des dieux. Toutefois, au fils du temps, certains Tenzokus ont perdu foi en l'humanité et se sont retirés, laissant la malveillance s'installer dans le cœur des hommes. Sorey, un humain élevé par des Tenzokus, arrive un jour dans le monde des humains et découvre que tout y est très différent par rapport à son village d'origine. Il va alors devenir le Doushi (Berger), afin de purifier ce monde et vaincre la source de ce chaos : le Seigneur des Calamités.

La guerre fait rage entre Kreeshna et Athnès. Lygatt Arrow y croise un ancien ami à la tête d'un petit groupe de combattants d'élite qui attaque Kreeshna : Zeth. Ce dernier ne connaissant pas les termes réels de la demande de capitulation, ils en sont poussés à se battre l'un contre l'autre.

Les événements se situent aux prémisses du jeu éponyme. Sorey est un jeune guerrier élevé par les Seraphins et possédant une forte énergie spirituelle lui permettant d’interagir avec eux. Un jour, il découvre une jeune femme évanouie dans un temple. Alors que Mikleo, son ami d'enfance, le prévient de ne pas se mêler aux humains, il décide de lui venir en aide. La jeune femme-chevalier en question est en réalité Alisha Difda, la princesse de l'empire d'Highland.

L'histoire se déroule dans un monde peuplé d'humains et d'êtres « divins », les Tenzokus. Ces derniers, qui sont invisibles pour la plupart des êtres humains, ont la capacité d'accorder leur bénédiction aux villes et villages et sont donc vénérés comme des dieux. Toutefois, au fils du temps, certains Tenzokus ont perdu foi en l'humanité et se sont retirés, laissant la malveillance s'installer dans le cœur des hommes. Sorey, un humain élevé par des Tenzokus, arrive un jour dans le monde des humains et découvre que tout y est très différent par rapport à son village d'origine. Il va alors devenir le Doushi (Berger), afin de purifier ce monde et vaincre la source de ce chaos : le Seigneur des Calamités.

L'histoire se déroule dans un monde peuplé d'humains et d'êtres « divins », les Tenzokus. Ces derniers, qui sont invisibles pour la plupart des êtres humains, ont la capacité d'accorder leur bénédiction aux villes et villages et sont donc vénérés comme des dieux. Toutefois, au fils du temps, certains Tenzokus ont perdu foi en l'humanité et se sont retirés, laissant la malveillance s'installer dans le cœur des hommes. Sorey, un humain élevé par des Tenzokus, arrive un jour dans le monde des humains et découvre que tout y est très différent par rapport à son village d'origine. Il va alors devenir le Doushi (Berger), afin de purifier ce monde et vaincre la source de ce chaos : le Seigneur des Calamités.

En 2977, les Terriens nagent dans l’opulence. Ils ont envoyé des robots qui exploitent les ressources d'autres planètes. Tout ce qui est récolté est distribué gratuitement à la population. Par le truchement de l'abrutisseur mondio-visuel, les seigneurs bloquent les pensées d'un peuple asservi. Dénué de pouvoir réflexif, celui-ci se croit heureux. Pourtant, une mystérieuse sphère noire, recouverte de glyphes inconnus, s'écrase sur Terre. Alors que le gouvernement mondial se montre incapable de réagir, une menace extraterrestre se concrétise bientôt via les Sylvidres, femmes guerrières longilignes au teint verdâtre. Leurs exactions sont attribuées à Albator et à ses pirates ; pourtant, lui seul prend la menace au sérieux et s'engage à les combattre.

L'histoire se déroule avec Conan Edogawa, Ai Haibara et leurs trois camarades de classe, les Détectives Boys, accompagnés du professeur Agasa, vont faire du camping près du Mont Fuji et sont invités suite à la rencontre de Tokiwa Mio à l'inauguration des deux tours jumelles de Nishitamashi dont elle est la propriétaire. Kogoro Mouri, Ran et Sonoko sont également invités. Cependant, d'étranges évènements semblent déranger Conan : À qui Haibara téléphone-t-elle à des heures indiscrètes ? Quelle est la cause d'une série de meurtres touchant les participants à la construction de ces deux tours ? Et que font les hommes en noirs qui guettent à proximité ?

Le quartier de Shibuya à Tokyo bat son plein pour la saison d'Halloween. La détective Miwako Sato est en robe de mariée devant un parterre d’invités, dont Conan bien sûr ! Soudain, un agresseur fait irruption dans la salle de réception et le détective Wataru Takagi, est blessé en tentant de protéger Sato. L’image de la Faucheuse qu’elle avait alors vue au-dessus du détective Matsuda plane désormais sur Takagi. Au même moment, voilà que l'auteur de l’explosion responsable de la mort de Matsuda s'évade de prison. Piégé par une mystérieuse personne déguisée, le détective Rei Furuya se retrouve avec une bombe autour du cou. Conan le retrouve dans l'abri souterrain où il se cache pour essayer de désarmer la bombe et là, ce dernier lui raconte les détails d'un incident ayant impliqué ses camarades de classe de l'académie de police : 3 ans plus tôt, ils ont rencontré un poseur de bombes nommé «Plamya» à Shibuya.

Une actrice de pièces de théâtre reçoit une lettre de Kaitô Kid, menaçant de voler un joyau appartenant à la jeune femme. Cette dernière décide de se faire aider par Kogoro Mouri. Selon lui, le vol aura lieu lors de la représentation de la pièce "Joséphine", à laquelle Julie (l'actrice) participe. Conan, Ran,les détectives Boys, Haibara et même Sonoko sont de la partie. Le Kid sera cette fois particulièrement facile à reconnaître (pour Conan, Agasa et Haibara en tout cas) car il se déguisera en Shinichi. Alors que la pièce avait été bien entamée, le Kid essaye de s'échapper mais Conan le poursuit et livre un combat contre lui en haut du théâtre.

Ran, Conan, Kogoro et les Détectives juniors sont invités à se rendre dans un tout nouveau parc d'attraction. Sonoko, grâce à sa situation familiale, est aussi de la partie. Mais si Kogoro est présent c'est avant tout pour résoudre une affaire. On remet tout d'abord à chaque invité un bracelet électronique qui est un pass pour toutes les activités, il est actif jusqu'à 22h, heure de fermeture du parc. Tandis que les autres partent profiter du parc, Conan et Kogoro sont mis au courant de l'enquête à résoudre. Néanmoins ce mystérieux client ne leur facilite pas la tâche et le nombre d'indices est restreint.

Lorsqu'un imitateur de Lupin est arrêté pour vol à l'étalage à Tokyo, des dizaines d'autres imitateurs convergent vers la ville pour blanchir le nom de Lupin III. Le vrai Lupin est également en ville, à la fois pour regarder le spectacle et pour voler un mystérieux objet appelé Ice Cube. Mais l'un de ces imposteurs a également des vues sur le Cube. Est-il assez bon pour battre l'original à son propre jeu ?

L'Île dérivante, la nouvelle île au trésor visée par Lupin et sa bande, abriterait le trésor national du royaume du Zufu, aujourd'hui sous la coupe du régime dictatorial du général Kubikari. Ce dernier tient le pays d'une main de fer et cherche à mettre la sienne sur le trésor de l'Île dérivante. Une rumeur faisant état que la fille du défunt roi serait la clé pour parvenir jusqu'au trésor, Kubikari la garde recluse jusqu'à ce qu'elle vienne à accepter de collaborer avec lui. Lupin tente alors d'enlever la princesse, mais son plan échoue : la princesse a échangé son rôle avec une agente secrète répondant au joli nom d'Oleander (Ole pour les intimes). Une stratégie remarquable mise au point par le redoutable inspecteur Zenigata, qui vient de débarquer au Zufu…

Nous sommes dans un monde qui a été divisé en deux grandes factions suite à une guerre qui a eu lieu il y a 10 ans. À l'est, il y a l'Union des Républiques de Zirnitra et à l'ouest, les Royaumes Unis d'Arnak. Désormais, les deux puissances sont en pleine course pour avoir le contrôle de l'espace. En 1960, le premier ministre de Zirnitra annonce le lancement du projet Mechtat qui a pour but de lancer des missions habitées dans l'espace. Pour cela, la ville de Laika 44 est construite pour y faire venir de nombreux candidats qui veulent être astronautes ainsi que des scientifiques.

Après un déménagement, Max (Kyôsuke Kasuga) et sa famille se retrouvent dans une autre ville. Il est inscrit au lycée de son quartier. Il a quinze ans et est doté, comme ses deux sœurs Manu et Fanny (Manami et Kurumi), de pouvoirs surnaturels : téléportation, télékinésie, psychokinésie, don de voyance, capacité de voyager dans le temps... Max va faire la rencontre de Sabrina (Madoka Ayukawa), musicienne rebelle qui a quinze ans elle aussi. Il fait ensuite la connaissance de Pamela (Hikaru Hiyama), la meilleure amie de Sabrina, qui tombe immédiatement amoureuse de Max...

Quelques jours avant le concert inaugural de la salle de concert Doumoto, une explosion blesse grièvement la violoniste de renommée internationale Kabe Souko et deux musiciens. Quand la police découvre que la victime avait quelques instants avant l'explosion envoyé un SMS à la chanteuse d'opéra Akiba Reiko, Conan et ses amis ne tardent pas à découvrir que cette dernière est déjà devenue la cible d'un agresseur particulièrement audacieux et prêt à tout pour la réduire au silence. Mais pour quelle raison ?

Il y a une explosion soudaine au bord géant des installations océaniques du sommet de Tokyo. L'ombre de Tōru AMOURO, qui travaille pour le Bureau de sécurité de l'Agence nationale de police comme Zéro, apparaît sur le site. En outre, le "triple-face" du personnage connu comme Rei FURUYA en tant que détective et apprenti de Kogoro Mouri, et il est également connu comme Bourbon , membre de l'organisation des hommes en noir. Kogorô est arrêté comme suspect pour l'explosion. Conan mène une enquête pour prouver l'innocence de Kogoro, mais AMOURO se met sur son chemin.

Shinichi Kudo, 17 ans, est un maître détective respecté malgré son jeune âge. Mais c'est précisément ce qui lui fera du mal quand il est empoisonné par deux hommes en noir et devient ainsi un enfant. Depuis lors, il enquête en tant que Conan Edogawa pour continuer à résoudre des affaires pénales et à condamner les hommes en noir.