Alors qu’une tempête solaire sans précédent menace les États-Unis, le système du trafic aérien est hors de contrôle. Air Force One et un avion de ligne sont bloqués sur la même trajectoire. Le cataclysme semble inéluctable…

La présidente des Etats-Unis apprend que des terroristes ont pris en otage un avion dans lequel se trouve son frère. Elle va rapidement devoir faire un choix entre la sécurité de la ville, menacée par l'attaque, et la vie de son frère...

1969, 80 km dans les eaux sovétiques. Le sous-marin Uss Acushnet est en mission de reconnaissance quand il se fait attaquer par Moby Dick, une baleine tout droit sorti de la préhistoire. Deux survivants sont connus: Boomer et son ami John Achab, qui fut le premier à détecter le monstre. L'attaque laissera des séquelles, Boomer ayant perdu l'usage de sa main droite; et Achab, sa jambe. 40 ans plus tard, le commandant Achab, aux commandes du dernier nés de la classe Virginia, l'Uss Pequod, dont il a supervisé les modifications, décide de prendre sa revanche. Cessant toute communications avec l'Amiral De Deers, Chef d'Etat-Major de la Troisième Flotte américaine- qui envoie Boomer, devenu capitaine, pour l'arrêter- il poursuit Moby Dick à la trace de ses attaques et force une biologiste, le Docteur Michelle Herman, et son assistant, Pip, à l'aider à la retrouver afin de mettre un terme définitif à ses attaques...