Depuis la perte de ses parents, tués par une bombe, Jonah voue aux trafiquants d’armes une haine implacable. Cet enfant soldat taciturne décide pourtant de faire un bout de chemin avec Koko Hekmatyar, une jeune vendeuse d’armes excentrique qui parcourt le monde. Il devient ainsi le neuvième de ses subordonnés et intègre malgré son jeune âge l’équipe des Jörmungand.

Depuis la perte de ses parents, tués par une bombe, Jonah voue aux trafiquants d’armes une haine implacable. Cet enfant soldat taciturne décide pourtant de faire un bout de chemin avec Koko Hekmatyar, une jeune vendeuse d’armes excentrique qui parcourt le monde. Il devient ainsi le neuvième de ses subordonnés et intègre malgré son jeune âge l’équipe des Jörmungand.

Le jour de la cérémonie d'entrée au lycée, Itsuki apprend que sa cousine Mahiru est enceinte. C'est alors qu'ils se retrouvent transportés dans le monde magique de Granvania envahi par des monstres appelés « impuretés ». Les seules personnes capables de combattre ces créatures sont les « enfants des étoiles », des enfants auxquels douze « femmes des étoiles » auront donné naissance. Pour rentrer chez lui, Itsuki doit donc trouver ces jeunes filles…

Mikuri Tomokzu est un lycéen ennuyeux, impopulaire, mauvais étudiant et célibataire. Il vit depuis la mort de ses parents chez Manase-san. La nuit qui précède son 16ème anniversaire il décide de se coucher plus tôt. Et se retrouve dans un monde un peu bizarre durant son rêve. C'est à ce moment la qu'apparaît une petite fille volante qui commence une bataille contre une sorte d'OVNI. Quand il se réveille il voit cette petite fille étrange dans son lit. La nuit suivante il se retrouve encore dans le même monde mais cette fois avec sa camarade de classe Mizuki. Quand il touche Mizuki elle se transforme en combattante. Et c'est à ce moment la que commence la bataille dans ce monde imaginaire.

Yamato, étudiant de deuxième année au lycée de Kawakami, traîne toujours avec sa bande d'amis d'enfance (quatre garçons et trois filles). Ils se connaissent tous depuis très longtemps et ont fait les quatre cents coups ensemble. Bien qu'ils aient tous beaucoup d'autres amis, ce groupe de sept est inséparable. Ils ont même une base secrète où ils se réunissent. Avec l'arrivée du nouveau semestre viennent de nouvelles connaissances, et l'entrée de deux nouvelles filles dans le groupe va petit à petit faire changer les choses…

Dans un monde où la place de chacun dans la société est déterminée dès l’enfance, seuls les meilleurs peuvent accéder au bonheur. Lors de l’examen décisif s’affrontent ceux qui ont choisi d’étudier (classe L / Learning) et ceux qui ont opté pour la triche (classe C / Cheating). Mumei Shokatsu (classe C) et Koi Oh (classe L) se retrouvent le jour des épreuves et devront se résoudre à s’affronter… ou à s’unir.

Amano Ginji et Mido Ban sont des récupérateurs qui se font appeler les Get Backers. Leur travail, c'est de retrouver tout ce qui a été volé ou perdu. Leur devise : « Satisfaction garantie à 100% ou presque ». Chacun d'eux possède un pouvoir particulier. Ginji, qui était aussi appelé l'Empereur de la Foudre, peut créer de l'électricité avec son corps et la contrôler. Quant à Mido, il possède le Jagan, aussi appelé Œil Maléfique, qui déclenche une illusion de 60 secondes. C'est dans les alentours de Shinjuku que les Get Backers, accompagnés de nombreux alliés, vont devoir affronter des ennemis plus forts les uns que les autres afin de remplir leurs missions. Mais peu à peu, les mystères du Mugenjō vont refaire surface et nos héros devront faire face aux fantômes de leur passé.

Amano Ginji et Mido Ban sont des récupérateurs qui se font appeler les Get Backers. Leur travail, c'est de retrouver tout ce qui a été volé ou perdu. Leur devise : « Satisfaction garantie à 100% ou presque ». Chacun d'eux possède un pouvoir particulier. Ginji, qui était aussi appelé l'Empereur de la Foudre, peut créer de l'électricité avec son corps et la contrôler. Quant à Mido, il possède le Jagan, aussi appelé Œil Maléfique, qui déclenche une illusion de 60 secondes. C'est dans les alentours de Shinjuku que les Get Backers, accompagnés de nombreux alliés, vont devoir affronter des ennemis plus forts les uns que les autres afin de remplir leurs missions. Mais peu à peu, les mystères du Mugenjō vont refaire surface et nos héros devront faire face aux fantômes de leur passé.

Le monde a commencé à s'effondrer. Le déchaîné Meicoomon absorbe Tailmon, qui a subi une sombre évolution, et se transforme en l'immensément puissant Ordinemon. Conformément aux prévisions d'Yggdrasil, le monde réel est sur le point d'être englouti par le monde numérique. Pendant ce temps, l'homéostasie considère qu'Ordinemon est hors de contrôle et met en place son plan final qui englobera le monde réel. Le temps est venu pour les DigiDestinés de prendre une décision finale. Quel avenir choisiront-ils pour eux-mêmes ?

Une énorme sphère vient soudainement de se former en émettant de mystérieuses vagues spirituelles. Suite à ces vagues, une mystérieuses femme apparait. Son but serait Shido et son groupe..

Meicoomon se déchaîne après avoir vu Meiko Mochizuki se faire blesser par l'homme ressemblant à Gennai. « Il aurait mieux valu que tu ne naisses pas… » Meicoomon disparaît dans le monde réel, qui s'est depuis déformé. Possédant un pouvoir écrasant, il est la clé de la destruction du monde.

En arrivant dans le monde numérique après le « reboot », les DigiDestinés sont poursuivis par un nouveau méchant. Pendant ce temps, Sora est troublée par l'indifférence de son partenaire Digimon à son égard.

Les DigiDestinés se rendent dans un parc à thème de sources chaudes voisin et tout le monde s'amuse, mais Joe ne vient pas car il veut étudier pour ses examens. Un autre Digimon infecté, Ogremon, attaque Odaiba. Gomamon s'enfuit de chez lui tandis que Mimi rencontre des problèmes avec les autres DigiDestinés et ses camarades de classe à cause de ses idées égoïstes.

Suite au combat contre Belial Vamdemon, le Digital World s'est refermé et les Élus ont repris leur vie dans le monde réel. Mais un jour, Kuwagamon apparaît subitement à Odaiba. Témoin de la scène, Taichi Yagami, désormais 17 ans, le prend en chasse, seul, mais il comprend bien vite qu'il est impuissant sans son partenaire. C'est alors qu'un miracle se produit.

Après avoir vu la transformation abrupte de Meicoomon et le meurtre de Leomon, Agumon et les autres Digimon sont maintenus isolés dans le bureau de Koushiro afin de les empêcher d'être infectés, mais des signes d'infection commencent à apparaître chez Patamon.