Au lendemain de la première guerre mondiale, dans une petite ville allemande, Anna se rend tous les jours sur la tombe de son fiancé, mort sur le front en France. Mais ce jour-là, un français est venu, lui aussi, fleurir la tombe de son ami allemand.

Berlin, 1940. Après la capitulation de la France, Adolf Hitler est au sommet du pouvoir. Le couple ouvrier Anna et Otto Quangel habitent dans un quartier modeste. Leurs voisins sont des fervents nazis, des juifs, des sympathisants du régime, des intellectuels : un échantillon de la société allemande de l’époque. Un jour de juin, la vie des Quangel bascule brutalement. Hans Quangel, le fils unique du couple, est un de ces jeunes hommes sacrifiés qui meurent au front. Avec sa disparition disparaît aussi l'unique raison de vivre que les Quangel avaient encore. Anna et Otto ne sont pas des résistants, ce sont des parents qui ont perdu leur enfant.

En avril 1941, des militants communistes serbes fuient les bombardements allemands et se réfugient dans une cave. Parmi eux, deux amis, Blacky et Marko, et une actrice, Natalija, convoitée par les deux hommes. Mais Natalija préfère jouer la carte allemande et frayer avec un officier, Franz. Peu à peu, Marko s'institue le seul intermédiaire entre les occupants de la cave et le monde extérieur. Au retour de la paix, il juge plus pratique de ne rien dire à ses camarades enfermés et leur cache la vérité. En 1961, tandis que Marko est devenu l'un des hommes de confiance de Tito, les résistants continuent de fabriquer des armes dans la cave, que l'habile Marko revend, empochant tous les profits. Sous terre, on célèbre le mariage de Jovan, le fils de Blacky…

Au cours de l’automne 1942, en France occupée, le sous-marin U-612 est prêt pour son voyage inaugural et se prépare à affronter une guerre de plus en plus brutale avec ses jeunes membres d’équipage, dont le nouveau capitaine, Klaus Hoffmann. Alors que les 40 hommes entreprennent leur première mission, ils se débattent dans des conditions de vie sous-marine étroites et claustrophobiques. Leurs personnalités se révèlent lorsque les tensions s’accroissent et les loyautés sont testées. Pendant ce temps, au port de La Rochelle, le monde de Simone Strasser devient incontrôlable alors qu’elle est plongée dans une liaison dangereuse et un amour interdit, tiraillée entre sa loyauté pour l’Allemagne et la Résistance, la poussant à tout remettre en question. Est-ce que tout ce qu’elle pensait être vrai pourrait n’être qu’un mensonge ?

Hannah est suspendue de ses fonctions et trie les dossiers dans les archives du Bureau. Elle n'a pas eu d'hallucination depuis un certain temps et se croit presque en bonne santé. Lucy, quant à elle, est sur une affaire: un couple de Berlin a disparu dans les vastes forêts de l'Uckermark. Ils sont venus d'une fête médiévale, ont traversé un village en voiture, puis se sont perdus de vue.

À peine arrivée à la PJ de Hambourg, la commissaire Katharina Tempel est chargée d’enquêter sur l’étrange disparition de deux médecins, Ulla et Hans Leitermann. Une enquête qui va entrer en résonnance avec son histoire intime.