La bataille finale et les révélations seront un peu plus nombreuses que dans la série. Les noms des parents de Kira y sont dévoilés, ainsi que le visage de Raw le Creuset.

Le second spécial est accès sur la fuite de l'Archangel en direction de l'Alaska, ainsi que son arrivé à Orb. C'est dans cette partie qu'aura lieu le combat de Kira et Asran.

Ce premier spécial relate le début de la série Mobile Suit Gundam SEED jusqu'à l'épisode 21. Après que Zaft ait volé les prototypes Gundam, Kira et ses amis se retrouvent embarqués sur l'Archangel, et Kira est obligé de combattre pour les protégés.

La guerre qui a déchiré la Terre et les PLANT pendant un an et demi s’est achevée après la bataille décisive de Jakin Due. Un traité de paix fut signé et le monde semblait enfin avoir retrouvé le chemin de la paix. Néanmoins, les tensions sont toujours palpables, que ce soit chez les Naturels ou chez les Coordinateurs. Ère cosmique 73, Shinn est un soldat de ZAFT et pilote de Mobile Suit en provenance d’Orb. Alors qu’il a perdu sa famille sous ses yeux lors du précédent conflit, il devra surmonter les horreurs d’une nouvelle guerre encore plus atroce…

Ère cosmique 70. La tragédie de la St-Valentin sanglante transforme les tensions qui existent entre la Terre et les PLANT en une guerre totale. Alors que tous prévoyaient une victoire de l’Alliance Terrienne, numériquement supérieure, les faits allaient démontrer le contraire. Onze mois ont passé depuis que le conflit s’est enlisé dans le statu quo. Kira, un jeune Coordinateur, vit et étudie avec ses amis Naturels sur Héliopolis. Leur quotidien sera chamboulé lorsque ZAFT attaquera la colonie censée être neutre…

Ère cosmique 70. La tragédie de la St-Valentin sanglante transforme les tensions qui existent entre la Terre et les PLANT en une guerre totale. Alors que tous prévoyaient une victoire de l’Alliance Terrienne, numériquement supérieure, les faits allaient démontrer le contraire. Onze mois ont passé depuis que le conflit s’est enlisé dans le statu quo. Kira, un jeune Coordinateur, vit et étudie avec ses amis Naturels sur Héliopolis. Leur quotidien sera chamboulé lorsque ZAFT attaquera la colonie censée être neutre…