"Secret Love Affair" raconte l'histoire d'une liaison secrète entre Oh Hye Won (Kim Hee-Ae), une femme d'une quarantaine d'années, et Lee Sun Jae (Yoo Ah-In), un homme d'une vingtaine d'années. Oh Hye Won travaille comme directrice de la planification à la fondation des arts Seo Han. Lee Sun Jae est un pianiste de génie.

L'histoire mouvementée d'une famille nord-coréenne, contrainte de fuir le nord et de passer au sud. Le fils ainé, sur le point de se marier, trouve difficile la fuite et le fait de laisser sa bien aimée derrière lui. Après un long périple, il n'attend qu'une chose : travailler et avoir assez d'argent pour faire passer la frontière à sa bien aimée...