Une dispute éclate dans une maison isolée dans les Vosges. Jean, le fils cadet de la famille, est jeté dehors. Il rejoint des chasseurs pour une battue et apprend à tuer. La nuit suivante, la voiture de sa mère est incendiée. On l'accuse. Jean disparaît alors dans la forêt…

A San Francisco, Jill Valentine doit faire face à une nouvelle épidémie de zombies. Tandis que Leon Kennedy est sur la piste d'un scientifique de la DARPA kidnappé, Claire Redfield traque un monstrueux poisson tueur de baleines. Rejoints par Chris Redfield et Rebecca Chambers, ils découvrent que leurs enquêtes respectives ont un point commun. Leurs indices convergent tous vers le même endroit : l'île d'Alcatraz, où un nouveau mal a élu domicile et attend leur arrivée.

Le nombre de personnes dotées de pouvoirs extrasensoriels appelées, Esper, est en augmentation. Ils se retrouvent à tous les postes : militaire, diplomatie, politique ; et dans tous les pays. Un pays qui contrôle les Espers est un pays qui peut contrôler le monde. Nous suivons Kyōsuke Hyōbu, ancien Esper des Forces d’autodéfense du Japon. Il a été emprisonné pendant 10 ans après son coup d’état pour dominer le monde. Mais durant la Seconde Guerre Mondiale, il arrive à s’échapper et reconstitue le groupe terroriste PANDORA pour venger la mort de ses camarades. En plus de pouvoir contrôler l’esprit des gens, Kyōsuke Hyōbu possède un pouvoir unique : Il ne vieillit pas…