L'histoire tourne autour des lycéennes qui découvrent l'attrait des motos. Sakura Hane est une étudiante du secondaire qui ressemble un peu à un airhead. Sur le chemin de son lycée féminin, un jour, elle est fatiguée d'escalader une route vallonnée avec une bicyclette, mais elle voit une fille nommée Onsa Amano qui fait du vélo. Sakura s'intéresse immédiatement aux motos, et elle et Onsa rejoignent le club de moto de l'école. Ensuite, Sakura entreprend d'obtenir sa licence.

Mira a toujours rêvé de faire partie d'un club d'astronomie une fois au lycée. Cette passion pour les astres date du jour où quelqu'un lui avait promis de découvrir de nouveaux astéroïdes, lorsqu'elle était plus jeune. Mais le lycée qu'elle vient d'intégrer a supprimé son club d'astronomie un an plus tôt et Mira doit se résoudre à fréquenter le club des sciences de la vie et de la terre.

Mira a toujours rêvé de faire partie d'un club d'astronomie une fois au lycée. Cette passion pour les astres date du jour où quelqu'un lui avait promis de découvrir de nouveaux astéroïdes, lorsqu'elle était plus jeune. Mais le lycée qu'elle vient d'intégrer a supprimé son club d'astronomie un an plus tôt et Mira doit se résoudre à fréquenter le club des sciences de la vie et de la terre.

 À l'occasion d'un séjour de 3 jours à Kyoto, la 3-E prépare avec enthousiasme son séjour mais aussi des plans d'assassinats impliquant un sniper engagé par le professeur Karasuma. 

Une mystérieuse flotte de navires surarmés appelée « La Flotte du Brouillard » est soudainement apparue dans toutes les mers du monde. L’humanité n’ayant pas la technologie nécessaire pour rivaliser contre une telle flotte, s’est retrouvée chassée des mers… 17 ans après la défaite de l’humanité, Gunzou Chihaya et son équipage, à bord du I-401, partent affronter la flotte du brouillard avec l’aide de l’intelligence artificielle, Iona.

Pour sauver le monde des effets secondaires des dernières expériences de Washu, Tenchi Masaki va s'infiltrer en tant que professeur. Il est immédiatement balayé dans un conflit entre le conseil d'étudiant et le club de science, qui possèdent tous deux un membre représentant la clé de la mission de Tenchi.

Yuki, une étudiante sourde, se retrouve un jour en difficulté lorsqu'un élève de son école, Itsuomi, lui vient en aide. Pourtant, Itsuomi n'est pas du tout déconcerté par le fait qu'elle n'entende pas et interagit naturellement avec elle. Alors qu'il l’entraîne progressivement vers un nouveau monde, Yuki commence à éprouver des sentiments pour Itsuomi…

Nagi est un élève sérieux passionné par ses études. Un jour, alors qu'il est en deuxième année, il découvre qu'il a été échangé à la naissance avec une fille. Espérant garder leurs enfants biologiques et adoptifs, leurs parents décident qu'ils vont se fiancer pour pouvoir rester en famille. Mais Nagi est déjà amoureux d'une autre fille...

Natsu, jeune fille timide, découvre qu'elle fait partie d'un groupe choisi pour assurer la survie de l'humanité sur une Terre qui a radicalement changé.